因为野生品种的佛州拟鳄龟分布水域一般会比较深。所以在人工养殖时，自然也可以让它们生活在深水之中。但水是没有必要太深的，否则会不利于佛州拟鳄龟的生长发育，而且换水以及打扫的过程也是比较麻烦的。

一般来说，可以将水位调节到佛州拟鳄龟的背甲高度3倍左右的地方。在这样的水位条件下，更有利于它们发育，也不会损害它们的健康。