苏格兰猎鹿犬的毛色有：深兰灰色、浅不同的灰色、斑点色、黄色、沙红色、红褐色，首选的毛色为深兰灰色，允许有白色的被毛，允许白色的毛发出现在胸前和脚趾，但前提是只限于深色的犬种。没有白色的出现最为完美，但有部分优秀的品种在尾尖稍稍带点白色。

苏格兰猎鹿犬若被毛为浅色则口吻为黑色，鼻镜呈兰色，且稍微有些弯曲。苏格兰猎鹿犬眼睛的颜色深，普遍为深褐色、褐色或榛色，眼圈呈黑色。苏格兰猎鹿犬在休息时，眼神显得很柔和，兴奋时，且充满锐利的目光，视线非常远。

苏格兰猎鹿犬的被毛为粗糙的刚毛，覆盖于身躯、颈部以及四肢上，其长度为7.6～10厘米；头部、胸部和腹部被柔软的毛发所覆盖。刘海位于前腿、后腿内侧的地方，但不能形成象柯利犬那样的“羽毛”。理想的被毛是浓厚、紧密、粗糙的，触摸的感觉粗硬、干涩。