赫曼陆龟在幼龟时期是很难分辨性别的，需要等它们体型稍大一些才比较容易区分。正常情况下，会根据它们尾巴和尾盾开的角度大小来进行区分。通常雌龟的尾巴更偏短小些，雄龟的尾巴则比较长且粗；雌龟的尾盾开合角度小一些，雄龟的尾巴远远超出尾盾的位置，因而尾盾开合的角度比较大。在成年之后，雄龟的体型会比雌龟的小一些。

赫曼陆龟不建议将公母放在一起养护。它们的性格比较活泼，具有一定的攻击性，不建议将性别不同的龟放在一起养护。在繁殖期间，雄龟会具有更强的攻击性，它不仅会为了争夺配偶而去攻击同类，有时还会追赶着咬雌龟的腿部和头部，所以，在这个阶段需要多注意观察它们的动向，从而避免雌龟受伤害。