红尾沙鼠的背部为灰棕色，毛基为灰色，占毛长的2/3以上。它的毛端部为沙黄色，毛间夹杂有少数黑色的长毛。

红尾沙鼠体侧的毛端部为浅沙黄色，毛尖为黑色，毛基为灰色只占毛长1/2左右，且灰色越向腹面变得越淡。端部为浅沙黄色也越向腹面越淡，最后接近白色。

红尾沙鼠的四肢内侧为白色，胸部中央毛基为浅灰色，毛尖为白色或带浅棕的黄色。尾巴呈棕黄色，至尾末端的毛束呈粟红色、粟褐色或粟黑色。